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Série 1 : Cinétiques Enzymatiques
Exercice 2 :
Exercice 3
Exercice 4
Exercice 5:
Exercice 6:
Série 2 : réacteurs enzymatiques
Série 3 : Cinétique microbienne
Série 4 : Les Fermenteurs
Série 1 Cinétiques Enzymatiques
Exercice 1 En cinétique enzymatique, on note : S : substrat (réactif) ; P: produit ; E : enzyme (catalyseur) Le schéma réactionnel est le suivant :
Hypothèses de l'exercice: [S]>> [E] (le substrat est en quantité très importante) [ES] complexe intermédiaire instable 1. Les expressions des vitesses de S, ES et P: Vs=? Vs = - d[S]/dt et d'après le schéma réactionnel Vs = k1 [E][S] - K-1 [ES] ...................(1) VES=? VES = d[ES]/dt = k1 [E][S] - k-1 [ES] - k2 [ES].........................(2) VP=? Vp=+d[P]/dt = k2 [ES] VP=k2 [ES]...................................(3) Les équations de conservation de substrat et de l'enzyme: →Bilan substrat [S0]=[S]+[ES]+[P] ...............................(4) →Bilan Enzyme
[E0]=[Et]=[E]+[ES].................................(5) 2. La concentration de [ES] (2)↔d[ES]/dt =0 (ES complexe intermédiaire instable ou hypothèse de l'état quasistationnaire du complexe ES) par conséquent: k1 [E][S] - k-1 [ES] - k2 [ES]= k1 [E][S] - (k-1 + k2 )[ES]=0 donc : [ES]=k1 [E][S] /(k-1 + k2 ) = [E][S]/ ((k-1 + k2 )/k1) si on note (k-1 + k2 )/k1 = KM la concentration de [ES] est égale à : [ES]= [E][S] / KM ..........................................(6) or (5)↔ [E]= [Et] - [ES] on remplace dans (6) : [ES]= ([Et] - [ES]) [S] / KM
[ES]=( [ET] [S] / KM ) +( [ES] [S] / KM ) → [ES] (1+ [S]/KM) = [ET] [S] / KM [ES] (KM +[S] / KM) = [ET] [S] / KM [ES] = [ET][S] / KM+[S].................................(7) 3.La vitesse de la réaction: V=k2 [ES] = k2 [ET][S] / KM+[S] (d'après l'équation 7) Si on note Vmax = K2 [ET]
V = Vmax [S] / KM+[S]
Exercice 3: Dans un réacteur fermé agité, on a l’hydrolyse de la pénicilline par un enzyme : Substrat=pénicilline A partir de ces données représenter 1/V = f(1/[S]) et V = f(V/[S]); avec V la vitesse de la réaction et S la concentration du substrat. GRAPHE 1:
GRAPHE 2:
1- L’hydrolyse de la pénicilline est elle- conforme au modèle de Michaelis-Menten? →Le tracé e 1/V =f(1/[S]) (Lineweaver-Burk) est une droite qui ne passe pas par l'origine →Le tracé e V =f(V/[S]) (Eadie-Hofstee) est une droite qui ne passe pas par l'origine
→ Ce qui implique que l'hydrolyse de la pénécilline est une cinétique Michaelienne 2.Calculer les paramètres cinétiques de l’hydrolyse de la pénicilline selon les deux linéarisations : →Selon Lineweaver-Burk (ou méthode des double-inverses):
1/V= 7622 1/[S] + 109 (d'après l'équation du graphique) Par identification : KM/VMax = 7622 , 1/VMax = 109 ↔ KM = 0.76 10-5 mol/L VMax = 10-9 mol/ L.min → Selon Eadie-Hofstée: Le tracé de V=f(V/[S]) donne une droite qui ne passe pas par l'origine de la forme y=a X + b avec :
par conséquent: La pente = - KM et ordonnée.orgine = VMax D'après le tracé , l'équation de la courbe de tendance est : y=5 10-6 x +7 10-10 (R2 = 0.999) On aura donc : KM = 0.5 10-5 mol/L VMax = 0.7 10-9 mol/ L.min Quelle est la linéarisation la plus représentative des données expérimentales ? →On doit calculer les vitesses théoriques pour chaque modèle, puis on calcul l'erreur: Erreur = E =[ (Vexp _ Vthéo ) / Vexp ]
Le modèle qui présente une erreur faible est le plus représentatif. Exemple de calcul des vitesses théoriques:
Vthéo pour le modèle Lineweaver-Burk:
S]
Km
Vmax
Vtheo
Vexp
E%
0.1 10-5
0.76 10-5
10-9
0,116279 10-9
0.11 10-9
5.708
0.3 10-5
0.76 10-5
10-9
0.283019 10-9
0.25 10-9
13.20
Vthéo pour le modèle Eadie-Hofstée: [S] 0.1 10-5 0.3 10-5
Km 0.5 10-5 0.5 10-5
Vmax 0.7 10-9 0.7 10-9
Vthéor 0.116667 10-9 0.2625 10-9
Vexp 0.11 10-9 0.25 10-9
E% 6.06 5
D'après le calcul d'erreur, le modèle 'Eadie-Hofstée' est le plus représentatif es données expérimentaux avec E≤ 6% 3.Comparer les résultats des régressions linéaire et non linéaire, quelle est la méthode d’analyse la plus précise ?
Pour comparer entre R.L (Eadie-Hofstée) et R.N.L , il faut d'abord calculer les vitesses théoriques pour chaque régression et: → de faire un calcul d'erreur →ou de porter les vitesses calculées et expérimentales sur un même graphique
le calcul d'erreur pour chaque régression donne le tableau suivant: Vexp 0.11 10-10 0.25 10-10 0.34 10-10 0.45 10-10 0.58 10-10 0.61 10-10
Vtheor .L 0.1166 10-10 0.2625 10-10 0.35 10-10 0.466 10-10 0.6 10-10 0.636 10-10
E% 6.06 5 2.94 3.7 3.44 4.32
Vtheo N.L 0.1123 10-10 0.252 10-10 0.337 10-10 0.449 10-10 0.577 10-10 0.612 10-10
E% 2.12 1.1 0.88 0.14 0.39 0.44
Conclusion: La régression non linéaire (R.N.L) est la méthode la plus précise
Série 2 : réacteurs enzymatiques Exercice 1 1. t=? pour que [S] soit hydrolysé à 99% Les données de cette question sont:
Réacteur fermé à 40°C avec VR=1000L
[S]0=1 mol/L et [E]0=1 g/L Cinétique sans inhibition Conversion x=99% : [S]f = 0.01[S]0
KM = 35 mmol/L , Vmax=10µmol/min.mgE
Exercice 2
Exercice 3
Série 3 : Cinétique microbienne Exercice 1
Exercice 2
Exercice 3
Exercice 4
Organigramme cinétique microbienne
Série 4 : Les Fermenteurs Exercice 1
Exercice 3
Exercice 4
Exercice 2