Phénotypes de Résistance Chez Les Entérobactéries 2019 [PDF]

Zitiervorschau

UNIVERSITÉ DE MONASTIR Ecole Supérieure des Sciences et Techniques de la Santé de Monastir

Phénotypes de résistance des entérobactéries aux béta-lactamines 3ème Année Biologie médicale Année universitaire: 2019/2020

Dr Hajer RHIM AHU en Microbiologie / CHU F. Bourguiba de Monastir 29/02/2020

Résistance naturelle des entérobactéries aux βlactamines Production de β-lactamases naturelles : 7 Groupes phénotypiques de résistance Groupe 0: Espèces dépourvues de β-lactamases: Salmonella spp, Proteus mirabilis Groupe1: Céphalosporinase de classe C de très bas niveau: Escherichia coli, Shigella spp Groupe 2: Pénicillinase bas niveau: Klebsiella spp, Citrobacter koseri Groupe3: Céphalosporinase de bas niveau: 3 sous groupes selon leur comportement vis-à-vis des C2G (CXM) et céphamycines (FOX):  S C2G et S FOX: Providencia rettgeri et Providencia stuartii  R FOX > C2G: Enterbacter cloacae, E. aerogenes et C. freundii  R C2G > FOX: Serratia marcescens et Morganella morganii

Résistance naturelle des entérobactéries aux βlactamines (2) Groupe 4: Céphalosporinase + pénicillinase: Yersinia enterocolitica Groupe 5: Céfuroximase:

Proteus vulgaris Groupe 6: BLSE chromosomique: Kluyvera

Entérobactéries: Phénotypes de résistance naturelle aux BL

Groupe 0 Sensible à toutes les β-lactamines P. mirabilis, Salmonella spp

Entérobactéries: Phénotypes de résistance naturelle aux BL (2)

Groupe 1 Céphalosporinase de classe C de très bas niveau E. coli et Shigella spp

Entérobactéries: Phénotypes de résistance naturelle aux BL (3)

Groupe 2 Pénicillinase bas niveau Klebsiella spp, C. koseri

Entérobactéries: Phénotypes de résistance naturelle aux BL (4)

Groupe 3 Céphalosporinase de bas niveau

Entérobactéries: Phénotypes de résistance naturelle aux BL (5)

Groupe 4 Céphalosporinase + pénicillinase Y. enterocolitica

Entérobactéries: Phénotypes de résistance naturelle aux BL (6)

Groupe 5 Céfuroximase P. vulgaris

Entérobactéries: Phénotypes de résistance naturelle aux BL (7)

Groupe 6 BLSE chromosomique Kluyvera

Entérobactéries: Phénotypes de résistance acquise

Pénicillinase acquise de bas niveau (PBN)

Plasmidique βla: TEM, SHV, OXA

AMX Amc TIC Tcc Cf Caz Ctx Fep Imp

R S R S S S S S S

Pénicillinase acquise de HAUT niveau (PHN)

Plasmidique βla: TEM, SHV, OXA

AMX AMC TIC TCC PIP Tzp CF Fox Caz Ctx Fep Imp

R R R IR R S R S S S S S

TEM Résistant aux Inhibiteurs (TRI)

Plasmidique βla: TEM+++ / SHV

AMX AMC TIC TCC PIP Tzp CF Fox Caz Ctx Fep Imp

R R I S S S S S S S S S

R R R

Céphalosporinase Hyperproduite (CHP) AMX AMC TIC TCC PIP Tzp CF FOX CAZ CTX Fep Imp

R R R R R I R R R R S S

Béta-lactamase à Spectre Élargi (BLSE)

CTX

FEP Plasmidique Initialement: Dérivés de TEM et SHV

AMC

TCC

CAZ

AMX AMC TIC TCC PIP Tzp CF Fox CAZ CTX FEP Imp

R I/R R I/R R S R S I I S S

R R R R

Test de synergie (TS)

Test à la cloxacilline (TC): Détection de BLSE chez des souches productrices d’une CHP

Milieu MH + 125mg/L de Cloxacilline

Carbapénèmase AMX R AMC R TIC R TCC R CF R CAZ R CTX R FEP I  R IMP R

Mécanismes de Rce des entérobactéries aux carbapénèmes

Imperméabilité + Céphalosporinase chromosomique ou plasmidique

Ou + BLSE

Carbapénèmases

Carbapénémases: Classification Classe

Enzyme

AMC

PIP/TZP

CTX

CAZ

IMP

ETP

ATM

A

KPC

S

I/R

R

R

S/I/R

I/R

R

B

IMP, VIM, NDM

R

I/R

R

I/R

S/I/R

I/R

S

D

OXA-48

R

R

S

I/S

I/S

I/S

S

BLSE souvent présente chez les souches productrices de KPC et OXA-48

Carbapénèmase Oxa-48 +++ • C3G S

• ATM S • IPM I/S

• ETP I/S

Cas clinique n°1

urgences

ECBU Samia. M (35 ans)

Brûlures mictionnelles, fièvre et douleurs lombaires ATCD d’hospitalisation en gynéclologie

Au laboratoire: ECBU Mise en culture:  En dénombrement à l’anse calibrée (10 µl) sur gélose ordinaire  Incuber 24 à 48h à 37°C Cytologie :  Cellule de Mallassez: Nombre de leucocytes et hématies/mm3 Lecture : Critères microbiologiques d’infection urinaire  Leucocyturie ≥ 104 /ml ou 10/mm3  Bactériurie > 100 colonies /boite

Culture

Gram  BGN

Oxydase (-) Api 10S

Escherichia coli

Comment étudier la sensibilité de cette souche aux antibiotiques? Réalisation d’un antibiogramme par méthode de disques

Résistance naturelle des entérobactéries aux βlactamines Production de β-lactamases naturelles : 7 Groupes phénotypiques de résistance Groupe 0: Espèces dépourvues de β-lactamases: Salmonella spp, Proteus mirabilis Groupe1: Céphalosporinase de classe C de très bas niveau: Escherichia coli, Shigella spp Groupe 2: Pénicillinase bas niveau: Klebsiella spp, Citrobacter koseri Groupe3: Céphalosporinase de bas niveau: 3 sous groupes selon leur comportement vis-à-vis des C2G (CXM) et céphamycines (FOX):  S C2G et S FOX: Providencia rettgeri et Providencia stuartii  R FOX > C2G: Enterbacter cloacae, E. aerogenes et C. freundii  R C2G > FOX: Serratia marcescens et Morganella morganii

Entérobactéries: Phénotypes de résistance naturelle aux BL (2)

Groupe 1 Céphalosporinase de classe C de très bas niveau E. coli et Shigella spp

• AMX R • TIC R • PIP R • IBL S/I/R • C1G R • FOX S • C3G R • IMP S

Cas clinique n°2

Réanimation

ECBU Brahim. M (65 ans)

Au laboratoire: ECBU Mise en culture:  En dénombrement à l’anse calibrée (10 µl) sur gélose ordinaire  Incuber 24 à 48h à 37°C

Cytologie : Cellule de Mallassez: Nombre de leucocytes et hématies/mm3 Lecture : Critères microbiologiques d’infection urinaire  Leucocyturie ≥ 104 /ml ou 10/mm3  Bactériurie > 100 colonies /boite

Culture

Gram  BGN

Oxydase (-) Api 10S

Klebsiella pneumoniae

Comment étudier la sensibilité de cette souche aux antibiotiques? Réalisation d’un antibiogramme par méthode de disques

Aminopénicillines (AMX) Carboxypénicillines (TIC) Uréidopénicillines (PIP)

Résistance naturelle des entérobactéries aux βlactamines Production de β-lactamases naturelles : 7 Groupes phénotypiques de résistance Groupe 0: Espèces dépourvues de β-lactamases: Salmonella spp, Proteus mirabilis Groupe1: Céphalosporinase de classe C de très bas niveau: Escherichia coli, Shigella spp Groupe 2: Pénicillinase bas niveau: Klebsiella spp, Citrobacter koseri Groupe3: Céphalosporinase de bas niveau: 3 sous groupes selon leur comportement vis-à-vis des C2G (CXM) et céphamycines (FOX):  S C2G et S FOX: Providencia rettgeri et Providencia stuartii  R FOX > C2G: Enterbacter cloacae, E. aerogenes et C. freundii  R C2G > FOX: Serratia marcescens et Morganella morganii

K. pneumoniae : Phénotype sauvage Groupe 2: Production d’une pénicillinase naturelle  AMX R  TIC R  PIP I/R

Antibiogramme de l’ECBU de notre patient • Que suspectez-vous devant cet antibiogramme? ETP

IMP

CMI (E-test)

CMI=1 mg/l

Ertapénème

CMI=0,5 mg/l

Imipénème

CMI aux carbapénèmes

˂ 2 mg/l

Imipénème

≥ 4 mg/l

˂ 0,5 mg/l ˃ 0,5 mg/l

Ertapénème

Détection via l’ertapénème +++

Détection des carbapénèmases Signes d’appel sur antibiogramme (EUCAST 2019) • Φ d’inhibition IMP < 17 mm • Φ d’inhibition ERT < 25 mm  CMI (E-test): • CMI Imipénème > 4 mg/l • CMI Ertapénème > 0,5 mg/l

Cas cliniquen°4

ECBU

urgences

Lamia. M (25 ans)

Brûlures mictionnelles, pollakiurie, T°37°C ATCDde cystites àrépétition

Au laboratoire:ECBU Mise enculture: ‐ Endénombrementàl’ansecalibrée (10µl) sur gélose ordinaire ‐ Incuber 24à48hà 37°C Cytologie : Cellule deMalassez: Nombredeleucocyteset hématies/mm3 Lecture : Critèresmicrobiologiques d’infectionurinaire ‐ leucocyturie ≥104/ml ou10/mm3 ‐ bactériurie >100colonies/boite

• L’ECBUde votre patiente a montré: – Leucocyturie >104 /ml – Culturemonobactérienne Quelle bactérie suspectez‐ vous?

Staphylococcus saprophyticus

À vous de jouer…

AMX

CTX

TCC

TZP

CF

AMC

FEP

CAZ

AMX Amc TIC Tcc Cf Caz Ctx Fep Imp

R S R S S S S S S

TIC

IMP Pénicillinase acquise bas niveau

AMX AMC TIC Tcc Pip Tzp Cf Fox Caz Ctx Fep Imp

TRI

R R I SR SR S S S S S S S

AMX AMC TIC TCC CF Caz Ctx Fep Imp

R I R I R S S S S

Pénicillinase acquise haut niveau

AMX AMC TIC TCC PIP Tzp CF Fox Caz CTX Fep Imp

R I R I R S R S SI R SI S

BLSE

Merci pour votre attention